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2005年3月18日、世界最大規模の環境団体であるIUCN(国際自然保護連合)のコウモ リ保護専門部会から、新石垣空港建設位置再考を求める要請文が国、県に送られた。 要請文では、建設予定地すぐそばの洞穴がコウモリのねぐら、繁殖、採食場所になっ ていることから、極めて重大な影響は避けられないと指摘している。また、コウモリ の繁殖場所が滑走路予定地と隣接し、生存に重大な影響を与えると指摘。人口洞窟や 導水管の敷設にも疑問を投げている。